“天地之间，六合之内，其气九州、九窍、五脏十二节，皆通乎天气。”也就是说天人是一体的。人只是从这个一体中的人为隔离，是整体的一部分，它的独立是相对的。人通过自己的阳与周围世界相联系，通过阴保持自身的相对独立，阴阳的作用就在于此。其实所有的事物都是如此。

人的相对性表现在人与天地的依赖和斗争中，这个过程是动态的，有时人是主动方，有时环境是主动方，人体的很多疾病就是人防守不密，为自然所攻破。所以内经中提到人要逆从阴阳，以保持人体的气血正常运行。

人体是通过呼吸和饮食来维持体内气血的运化。这个运化过程与天地之间物质的运化有相似性。轻清的上扬，重浊者下行，饮食消化的有用的东西就是通过这种运动输送到需要它们的地方，这其实是一个阴阳分化＋阴阳互补的过程。输送渠道也有阴阳，血管内为阴，外为阳，外部的范围就大了，所有器官之间、肌肉腠理都可形成渠道，这样形成的固定渠道就是经脉，这样的渠道形成与各部分需要的成分及轻重缓急有关。由此使食物的精华充盈于整个人体，滋养人体的角角落落，使其保持活性。在这里中西医的分野就出现了，内经把人体分部，所谓三部九侯，而西医只认器官，所谓物质性的东西，而这些东西并不是人体的全部，因为有虚的地方存在，那么西医对人体的认识就是片面的，难以形成完整的理论，找不到经脉也是自然的。

-“-谷入于胃，乃传之肺，流溢于中，布散于外，精专者行于经隧，常营无已，终而复始，是谓天地之纪。”
“气之不得无行也，如水之流，如日月之行不休，故阴脉荣其脏，阳脉荣其腑，如环之无端，莫知其纪，终而复始，其流溢之气，内溉脏腑，外濡腠理。”
“人受气于谷，谷入于胃，以传与肺，五脏六腑，皆以受气，其清者为营，浊者为卫，营在脉中，卫在脉外，营周不休，五十度而复大会，阴阳相贯，如环无端。”
-“此外伤于风，内开腠理，毛蒸理泄，卫气走之，固不得循其道，此气慓悍滑疾，见开而出，故不得从其道，故命曰漏泄。”

内经中谈到用针灸治病的方法是“虚则实之，满则泄之，宛陈则除之，邪胜则虚之。”主要是调理气血，使之平衡，但也不排除对抗疗法：“宛陈则除之”。可见中医的治病采取的也是两手：疏导和以暴制暴，重在疏导。这和西医的对抗疗法形成对比。疏导在于恢复自身生理机能，提高免疫力，使病菌失去生存的土壤。对抗则是杀灭病菌，无意于提高机体机能，只能使气血恢复低水平的平衡，甚者伤及其它组织，留下后患。现在的单组分药物实际就是一把无形的刀子，他在杀灭中难免伤及左右。但这种方法救急非常有效，这是它的优势，能够解决疏导无法解决的问题。所以治病时，如果中医有把握治好就用中医，中医能做到保全，中医没把握再求助西医，用西医就要承担可能留下后遗症的思想准备，西医可以得起正但须留其负。由此也可以看出阴阳两手的重要性，如此才能做到全面和周及。

中药是在五行分类指导下的有目标的搜寻和筛选的，因为针对五脏的调理有对应的五味五色要求，这种要求大大缩小了药物选择的范围，可以为药物筛选预设路线、指明方向。

《黄帝内经》对人体结构及气血运行做出了详尽的分折，指出各类疾病形成的内外原因、发展轨迹及治疗原则，详细论述了针灸治序的方法及理论，是运用阴阳五行的方法和理论解决现实问题的经典之作，它通过具体的事物，解析说明了阴阳理论的所有要点，为我们认识理解阴阳哲学提供了具体素材，是留给我们后人的宝贵财富。