O2-M122下游各支系的起源地与扩张路线、共祖时间
O2b-F742（旧称O3*-M122）整体上是华东偏多。华东惊现高比例的O3早期分支F742。O2-M122下最早的O2a-M324的兄弟分支O2b-F742在山东江苏高频，高达10%，再者在浙江上海河南占5%，可判断F742早期居于东部沿海。数据表明，O2-M122从中亚入新疆至华北的北线迁徙假设将被完全否定，O2-M122诞生及早期M324、F742分叉于内陆云南也变得基本没有可能。由于台湾原住民及海南黎族没有F742，推测华东的F742是源自东部沿海O2-M122突变分化的。O2a2b1-M134/O2a2b1a-F450有两大分支：O2a2b1a1-M117与O2a2b1a2-F114(另称F444)。F114的下游支系O2a2b1a21-F46目前整体上在华南、西南和蒙古高原偏少，在河南、河北、山东、江苏尤为集中，最大亮点是胶东和苏北，O2a2b1-M134分叉于内陆云南也变得基本没有可能，再次证明O2a2b1a2-F114是源自自黄河下游O2a2b1a-F45突变分化的，约是8500年前在黄河下游平原经历了强烈的农业人口扩张，逐渐形成了现今汉族的主体成分之一。
《Y-chromosome O3 Haplogroup Diversity in Sino-Tibetan Populations Reveals Two Migration Routes into the Eastern Himalayas》：CTS1642在藏缅语族那么高频，尼泊尔最近的上树的一个M117也是CTS1642，这一支可能是率先扩张的F5下游，推算汉藏分离下限在3000年，应当标记青铜时代前后，自甘宁青地区延藏彝走廊向南方迁移的古羌人。F5在黄河中下游如此高频，显然是奠基者效应。
O2a1-L127.1有两大分支O2a1a-Page127和O2a1c-IMS002611，华东惊现高比例的O2a1a-Page127。O2a1c-IMS002611的兄弟分支O2a1a-Page127集中分布于河南山东安徽江苏，并且外延分布于河北浙江，可判断O2a1-L127.1早期居于东部沿海。由于西南地区、台湾原住民及海南黎族基本没有O2a1-L127.1，O2a1a-Page127分叉于内陆云南也变得基本没有可能，推测O2a1a-Page127是源自东部沿海O2a1-L127.1突变分化的。
研究需要材料、工具方法。
先说材料吧，材料当然就是DNA源数据，在搜索引擎搜索Reich lab可以进入David Reich的实验室网站：
点击dataset， 可以看到有各个年份已发表论文的DNA数据，包括古代人群和现代人群，这些都是可以免费下载的。
也许有人还不知道这个David Reich是何方神圣，他是付巧妹和王传超读博期间的老师，全世界古DNA研究的先驱人物，哈佛医学院教授。
同样是在David Reich实验室的网站，点击software，有一系列的软件工具可供免费下载，包括你在论文中经常看到的那些算法工具，比如ADMIXTURE，PCA(页面中的EIGENSOFT，虽说PCA是一个非常常见的机器学习算法，很多软件都有这个功能，但是适合用于生物信息领域的还是这个eigensoft)，还有F3,F4,D等统计算法的工具等。
不过需要提醒：
这些软件都是没有UI界面的！！！！！需要你自己在linux的命令行终端中键入命令来运行！！
这些软件对于使用者比较不友好，安装就很麻烦，需要先安装配置很多其他运算库才能运行软件！！！
最好对英文比较上手，因为其说明文档都是英文的，并且你上网搜索帮助往往都只有英文网页才有你需要的信息！！
接下来来讲讲像f3, f4, D这类算法的结果怎么看吧？
f3有两种功能：检测共享基因漂变的数量， 检测某个族群是否能看做另外两个族群的混血
检测共享基因漂变的数量: f3(A,B;X)，检测A与B在与X分离之后，AB双方共享漂变的数量，数值越高说明双方共享漂变越多；比如f3(Han, Ami ; Mbuti)，就是检测在与非洲Mbuti人分离后，汉族和阿美族共享漂变的数量，由于这里选择了mbuti作为外围族群（即X），算法在对比汉族和阿美族共享漂变时，会先排除掉汉族和阿美族中那些与非洲Mbuti人共享的漂变，再对比剩下中两者共享的部分。
f3数值高，说明：两者分化晚，或者是两者之间有混血。
反过来用f3检测某个族群是否能看做另外两个族群的混血：
如果 f3(A,B;X)为负数，并且其输出报告中的Z值足够大，则X可以被视为AB两个族群的混血。比如你要是运行f3(Han, French; Uyghur)，就会得到一个负数，并且其Z值也会很大。
如果D(w,x,y,z）为负数，那么相对于族群z，x则更接近于族群y，反之为正数，则相对于族群y，x与z更接近。
如果D(w,x1,y,z）为正数，D（w,x2,y,z）也是正数，且D(w,x1,y,z）>D（w,x2,y,z），则说明x1比x2要更接近于z。
反过来负数也是如此。
先说材料吧，材料当然就是DNA源数据，在搜索引擎搜索Reich lab可以进入David Reich的实验室网站：
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也许有人还不知道这个David Reich是何方神圣，他是付巧妹和王传超读博期间的老师，全世界古DNA研究的先驱人物，哈佛医学院教授。同样是在David Reich实验室的网站，点击software，有一系列的软件工具可供免费下载，包括你在论文中经常看到的那些算法工具，比如ADMIXTURE，PCA(页面中的EIGENSOFT，虽说PCA是一个非常常见的机器学习算法，很多软件都有这个功能，但是适合用于生物信息领域的还是这个eigensoft)，还有F3,F4,D等统计算法的工具等。
不过需要提醒：
这些软件都是没有UI界面的！！！！！需要你自己在linux的命令行终端中键入命令来运行！！
这些软件对于使用者比较不友好，安装就很麻烦，需要先安装配置很多其他运算库才能运行软件！！！
最好对英文比较上手，因为其说明文档都是英文的，并且你上网搜索帮助往往都只有英文网页才有你需要的信息！！
接下来来讲讲像f3, f4, D这类算法的结果怎么看吧？f3有两种功能：检测共享基因漂变的数量， 检测某个族群是否能看做另外两个族群的混血
检测共享基因漂变的数量: f3(A,B;X)，检测A与B在与X分离之后，AB双方共享漂变的数量，数值越高说明双方共享漂变越多；比如f3(Han, Ami ; Mbuti)，就是检测在与非洲Mbuti人分离后，汉族和阿美族共享漂变的数量，由于这里选择了mbuti作为外围族群（即X），算法在对比汉族和阿美族共享漂变时，会先排除掉汉族和阿美族中那些与非洲Mbuti人共享的漂变，再对比剩下中两者共享的部分。
f3数值高，说明：两者分化晚，或者是两者之间有混血。
反过来用f3检测某个族群是否能看做另外两个族群的混血：
如果 f3(A,B;X)为负数，并且其输出报告中的Z值足够大，则X可以被视为AB两个族群的混血。比如你要是运行f3(Han, French; Uyghur)，就会得到一个负数，并且其Z值也会很大。
如果D(w,x,y,z）为负数，那么相对于族群z，x则更接近于族群y，反之为正数，则相对于族群y，x与z更接近。
如果D(w,x1,y,z）为正数，D（w,x2,y,z）也是正数，且D(w,x1,y,z）>D（w,x2,y,z），则说明x1比x2要更接近于z。
反过来负数也是如此。
四万年前田园洞人是东欧亚的一支，进化成古东亚人。古东亚人南下途中，有小支流改路去山东，但主支直到福建后形成了奇和古人、亮岛2号，属古东亚人的南支。同时古东亚人北迁途中，有部分支流改路去山东，但主支直到华北，形成了裕民文化，属于古东亚人的北支。这两小支流在山东融合形成沿海东亚人。这就是田园洞人常染血缘圈。
四万年前田园洞人是东欧亚的一支，进化成古东亚人。古东亚人南下途中，有小支流改路去山东，但主支直到福建后形成了奇和古人、亮岛2号，属古东亚人的南支。同时古东亚人北迁途中，有部分支流改路去山东，但主支直到华北，形成了裕民文化，属于古东亚人的北支。这两小支流在山东融合形成沿海东亚人。这就是田园洞人常染血缘圈。
粉色常染成分是苗族的标志性基因，在湖南汉族的血统中占了过一半，充分说明有一半湖南汉人是汉化苗人，祖先出自古苗。全国汉族的血统基本源自黄河下游，以7500~9500年前的山东古人为始祖。
O2a2b1-M134的兄弟支系O2a2b2-AMO1822富集分布于山东河南河北江苏，可判断AMO1822早期居于东部沿海。数据表明，AMO1822从西南至华北的南线迁徙假设将被完全否定，早期M134、AMO1822分叉于内陆云南也变得基本没有可能。推测AMO1822与M134的早期分化地点最可能是是中国东部。